Background La revendication ... La majeure partie de la diversité génétique chez l'homme se trouve en Afrique ... est assez courant. Sur Biology.SE, il est facile de trouver des articles qui font cette affirmation. Considérez par exemple: Question Je comprends que le terme diversité génétique est souvent utilisé dans un sens vague. Veuillez vous assurer d'expliquer quelles statistiques ont été prises en compte dans l'étude à laquelle vous vous référez pour donner des estimations de la fraction de la diversité génétique trouvée en Afrique. Notez que je ne demande pas "pourquoi est-ce vrai?" mais seulement "est-ce vrai"?
Voici un arbre basé sur les variations de l'ADN mitochondrial dans les populations humaines.
En regardant la distance génétique entre les populations via l'ADN des mitochondries, tout les nonafricains descendent d'un fondateur dans un groupe d'ADNmt (L3). Tous les autres groupes L sont des populations africaines: L0 est le peuple San, L1 les pygmées Mbenga, L5 les pygmées Mbuti et les autres sont d'autres groupes africains.
Si l'on considère que chaque haplogroupe L représente une variation génétique, alors 5/6 (83%) de la variation génétique humaine provient de populations africaines.
D'une source différente regardant la génétique différemment Une carte de la variation du génome humain à partir du séquençage à l'échelle de la population Nature. 28 octobre 2010; 467 (7319): 1061–1073
Les populations d'ascendance africaine ont fourni le plus grand nombre de variantes et contenaient la fraction la plus élevée de nouvelles variantes, reflétant la plus grande diversité des populations africaines. Par exemple, 63% des nouveaux SNP dans le projet à faible couverture et 76% dans le projet exon ont été découverts dans les populations africaines, contre 20% et 33% dans les populations d'ascendance européenne pour les projets exon et faible couverture respectivement.
J'ai trouvé deux articles qui fournissent des informations à ce sujet, mais aucune réponse définitive.
Le 1000 Genomes Project Consortium (2015) a analysé des génomes entiers et a constaté que «28% des nouvelles variantes» étaient trouvées chez des individus africains. Les nouveaux variants étaient pour la plupart (> 99,9%) des polymorphismes mononucléotidiques ou des indels courts. Ce tableau contient le décompte complet de toutes les variantes. Cependant, 26% des génomes étaient africains, tandis que les Africains représentent environ 16% de la population mondiale, de sorte que ces chiffres ne peuvent pas être extrapolés au monde entier. Un autre problème est que les échantillons n'ont pas été prélevés sur des personnes géographiquement dispersées (figure 1).
Figure 1. Proportion de variations génétiques partagées dans différentes populations.
Les preuves d'une plus grande diversité génétique africaine sont présenté par Stephens et al (2001), bien qu'ils examinent les Nord-Américains de différents groupes ethniques, ce qui n'est pas idéal. Ils ont trouvé beaucoup plus de SNP uniques chez les Afro-Américains que les autres groupes ethniques.
Figure 2. Les SNP chez les Américains de différents groupes ethniques. Les codes de population sont AF , Afro-américain; AS, asiatique; CA, caucasien; et HL, hispanique-latino.
Je n'ai pas été en mesure de trouver dans la littérature que la plupart des variations génétiques humaines existent en Afrique, bien que l'Afrique soit caractérisée comme ayant une diversité, par exemple ici. Je suis sûr que j'ai entendu cette affirmation en dehors de Stackexchange.
Ma revue de la littérature n'est certainement pas exhaustive, donc si quelqu'un trouve autre chose, n'hésitez pas à l'ajouter.
Deux nouvelles études, résultat du projet sur le génome humain, ont examiné la diversité génétique de plus de 1000 individus de 51 groupes de population du monde entier.6, 7 Comme dans les études précédentes, les peuples d'Afrique étaient les plus génétiquement diverse. Cependant, ces études ont également déterminé que ceux du Moyen-Orient étaient les deuxièmes plus diversifiés génétiquement. difficile à interpréter
http://www.godandscience.org/apologetics/humans_out_of_africa.html
Je pense que cela signifie que l'Afrique contient 150000 à 500000 ans d'héritage humain dans une large base de population, alors que la base pour le reste du monde est plus étroite ... comme si vous aviez 10 couleurs de chats dans un enclos et que seulement 3 couleurs de chats avaient emménagé dans le se garer de l'autre côté de la route et s'y reproduire.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4067985/
Conforme au modèle «Out of Africa» d'origine humaine moderne, les analyses des données génétiques indiquent que les Africains ont des niveaux de diversité génétique plus élevés que les non-Africains (Cann et al. 1987, 2002; Tishkoff et al. 1998; Marth et al. 2004).