De toute évidence, un zygote n'abrite aucun microbe. Au fur et à mesure qu'il se développe et que le tissu du tube digestif est différencié, je suppose logiquement qu'il n'y a toujours pas d'activité microbienne dans l'intestin du fœtus. Je suppose donc également que le début de l'activité microbienne dans les intestins se produit après la naissance, mais quand et comment?
Les nouveau-nés n'ingèrent-ils que certaines souches, par exemple E. coli ? L'intestin est-il un environnement sélectif dans lequel seules certaines souches E.coli se développent?
Existe-t-il des mécanismes pour garantir que les bactéries nocives ne résident pas initialement dans l'intestin? Le tube digestif d'un nouveau-né est-il particulièrement instable et inefficace tant que les microbes appropriés ne sont pas établis?