Graphique des valeurs C (la masse d'ADN dans une seule cellule haploïde); il n'y a pas d'ordre logique dans les groupes:

[ source]

Paires de base dans le génome haploïde (certaines exemples):

• Escherichia coli (bactérie): ~ 4,5 millions
• Caenorhabditis elegans (ver nématode): ~ 100 millions
• Homo sapiens (nous savons tous ce que c'est): ~ 3 milliards
• Pinus taeda (conifère ): ~ 22 milliards
• Prorocentrum micans (algues unicellulaires): ~ 245 milliards

À partir de ces données, nous pouvons conclure:

• Différentes espèces n'ont pas la même taille de génome.
• La taille du génome n'est pas corrélée à la complexité. La complexité organisationnelle peut être difficile à définir mais, qualitativement, je pense que nous pouvons tous convenir qu'un humain est plus complexe qu'une algue unicellulaire. Et pourtant, les humains ont un génome 80 fois plus petit. C'est ce qu'on appelle le paradoxe de la valeur C. Notez, cependant, que ce paradoxe a été résolu après qu'il a été constaté que les génomes de la plupart des eucaryotes contiennent une grande proportion d'ADN non codant et répétitif.

Lectures complémentaires:

Le paradoxe de la valeur C, l'ADN indésirable et ENCODE par Eddy SR

La complexité du génome eucaryote par Pray L

Un Canadien a déjà mentionné que la taille du génome diffère d'un organisme à l'autre. Mais qu'en est-il de la complexité?

Nous devons d'abord définir ce qu'est la complexité: la complexité peut être définie comme le nombre de types de cellules différents qu'un organisme multicellulaire peut produire, avec le même génome. Oui, la complexité n'est pas corrélée à la taille du génome. Cependant, il semble être en corrélation avec le nombre de gènes. Selon Kauffman, le nombre de types de cellules, c'est-à-dire la complexité, est linéairement corrélé (corrélation directe) avec la racine carrée du nombre de gènes.

Bien que Kauffman dit que la complexité augmente avec le contenu d'ADN, ce qui n'est pas vraiment vrai, il est certainement possible que cette complexité soit corrélée avec le nombre de gènes. Le livre est un peu vieux et certainement la biologie moléculaire et cellulaire a vu beaucoup de progrès à cette époque. Cependant, un nombre théoriquement plus élevé de gènes distincts devrait produire des phénotypes plus complexes que Kauffman justifie en utilisant son modèle NK. Cette hypothèse a de nouveau été réfutée. Le problème serait que les doublons / gènes polyploïdes exacts ne devraient pas être comptés comme des gènes différents. De plus, les gènes métaboliques ne doivent pas non plus être comptés (les plantes / bactéries ont un nombre plus élevé de voies métaboliques fonctionnelles). La complexité de l'organisme est due à la complexité du réseau de régulation des gènes qui à son tour dépend du nombre de gènes de régulation. Le modèle NK suppose également d'une certaine manière des gènes régulateurs (c'est-à-dire des gènes qui peuvent interagir les uns avec les autres). La complexité ne peut certainement pas naître de rien. Je ne trouve pas les données à ce sujet pour le moment, mais la théorie est tout à fait plausible.

Un autre point que je voudrais ajouter est que la complexité ne signifie pas seulement la complexité spatiale. La complexité peut également être temporelle.

^{Référence:
Stuart A Kauffman (1993) Les origines de l'ordre, chapitre 12}

Je peux montrer les faits ici.

Humain:

longueur totale: environ 3 000 000 000

gènes de codage: environ 50 000 (y compris ceux prédits)

3 000 000 000/50 000 = 60 000

Numéro de chromosome: 23

Poisson zèbre:

longueur totale: environ 1 400 000 000

gènes de codage: environ 36 000 (y compris ceux prédits)

1 400 000 000/36 000 = 38 889

Numéro de chromosome: 25

Fruitfly:

longueur totale: environ 1 400 000 000

gènes de codage: environ 19 000 (y compris ceux prédits)

1 400 000 000/19 000 = 73 684

Numéro de chromosome: 4

Saccharomyces cerevisiae:

longueur totale: environ 12 000 000

gènes codants: environ 7 000 (y compris ceux prédits)

12,000,000/7,000=1,714

Numéro de chromosome: 16

http://useast.ensembl.org/Homo_sapiens/Info/Annotation http://useast.ensembl.org/Danio_rerio/Info/Annotation http://useast.ensembl.org/Drosophila_melanogaster/Info/Annotation http : //useast.ens embl.org/Saccharomyces_cerevisiae/Info/Annotation