Pour la plupart, ils ne sont pas utilisés. il existe des racémases d'acides aminés, qui interconvertissent les formes L et D de certains acides aminés spécifiques, qui peuvent être utilisées dans certaines voies biosynthétiques ou métaboliques particulières.

Je pense en particulier à la luciférase de luciole qui utilise la D-cystéine comme réactif de re-dox pour régénérer le substrat de luciférine consommé par l'enzyme génératrice de lumière. voir la diapositive 4 ici.

Les peptides synthases non tribosomales utilisent aussi souvent des acides aminés D.

Je ne crois pas que les d-acides aminés soient vraiment incorporés dans les protéines.

Vous pourriez également être intéressé par la D-amino-acide oxydase ( EC 1.4.3.3), une flavoprotéine (FAD) hautement spécifique de la forme D de l'amino acides, qui a été découvert par Hans Krebs en 1935 (voir ici), et qui a une large distribution (y compris chez l'homme).

L'enzyme a été étudiée de manière très approfondie, en particulier par les collègues de Massey & (voir ici par exemple)

D-amino-acide oxydase ( EC 1.4.3.3) catalyse la réaction qui entraîne la transformation suivante

D-acide aminé + H _{2 sub> O + O 2 = 2-oxo carboxylate + NH 3 + H 2 O 2}

Les 2-oxo-carboxylates sont ce que l'on appelait autrefois les α-céto-acides. Par exemple, le pyruvate est produit à partir de D-Ala.

Le produit de la réaction enzymatique est l’imino-acide qui est hydrolysé de manière non enzymatique en acide a-céto (voir Pollegioni et al ., 1994, et références)

Une excellente critique

• D-Amino Acid-oxydase: rôle physiologique et applications

  par SV Khoronenkova & VI Tishkov,

  Biochemistry (Moscou) est disponible gratuitement sur ici

Ces auteurs ont des choses intéressantes à dire sur la D-Serine, la D-Proline et la D-Alanine, et bien plus encore.

Référence supplémentaire

• Pollegioni L, Fukui K, Massey V. (1994) Études sur le mécanisme cinétique de la D-aminoacide oxydase de rein de porc par site mutagenèse de la tyrosine 224 et de la tyrosine 228. J. Biol. Chem. 269 , 31666-31673. [ pdf]

De nombreux acides aminés D ne sont pas du tout utilisés, bien que certains aient un métabolisme assez élaboré, à la fois en synthèse et en utilisation: la D-alanine par exemple.