D'après Choi et al. Genome Biology 2009, 10: R89, la méthylation de l'ADN aux deux limites de codage peut réguler l'élongation de la transcription et stabiliser l'épissage en réduisant les occurrences de saut d'exon.

Extrait du résumé:

Nous rapportons ici une observation à l'échelle du génome de pics distincts de nucléosomes et de méthylation aux deux extrémités d'une unité de codage de protéine. Les polymérases allongées ont tendance à faire une pause près des deux extrémités de codage immédiatement en amont des pics épigénétiques, provoquant une réduction significative de l'efficacité d'élongation. Les caractéristiques conservées dans les séquences de codage des protéines sous-jacentes semblent dicter leur conservation évolutive à travers plusieurs espèces. Les marques nucléosomiques et de méthylation sont généralement associées à une forte propension à la flexion de l'ADN codé en séquence, mais de manière différentielle avec la densité CpG. Au fur et à mesure que le gène se développe, les codes épigénétiques semblent être déplacés des séquences internes variables vers les régions limites, rendant les pics plus proéminents dans les organismes supérieurs.

Leurs données (figures 1 et S2), cependant, ne supportent pas une augmentation généralisée des régions 3 'UTR dans les cellules T humaines, le foie de souris, la levure ou les mouches.