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2013-07-08 12:54:03 UTC
J'ai fait un profilage d'expression à partir des données RNAseq disponibles publiquement pour les tissus de souris. Alors que pour le foie et les testicules, je reçois des protéines attendues dans les ARNm les plus exprimés, pour le cerveau , je reçois de la ferritine (chaîne lourde de ferritine 1: Fth1 ) comme l'ARNm le plus exprimé!
Il existe quelques études qui rapportent des taux élevés de ferritine et de fer dans les maladies neurodégénératives, tandis que d'autres ont impliqué son rôle dans le vieillissement.
Je n'ai rencontré aucune étude sur le métabolisme du fer dans le cerveau normal. Le métabolisme du fer joue-t-il un rôle important dans le fonctionnement du cerveau?
PS:
- Les données dont je parle ont le numéro d'accès SRA - SRR652247 (j'ai essayé les trois essais soumis dans SRA)
- Les souris utilisées dans l'expérience étaient âgées de 11 semaines
- J'ai utilisé bowtie -> eXpress pour la quantification des lectures RNAseq.
Regardez le résumé de l'étude - il décrit le profilage d'expression dans les testicules. Pensez-vous qu'ils ont peut-être mal étiqueté l'organe?
Je ne pense pas ... parce que l'échantillon de testicules a un niveau élevé d'expression de protamine qui n'est pas là dans le cerveau. En outre, le transcrit le plus exprimé (tous les ARN) dans le cerveau est * Bc1 * - un ARNc connu pour réguler la traduction au niveau des synapses.
Comme d'habitude, l'association du NDD ou de l'âge avec Fe ne signifie pas que c'est l'agent causal, ni vice versa.